Προθερμάνετε το φούρνο στους 200 °C.

Σε ένα μεγάλο πυρίμαχο τηγάνι ζεστάνετε το ελαιόλαδο σε μέτρια προς δυνατή φωτιά. Προσθέστε το κρεμμύδι και το πράσο και τσιγαρίστε μέχρι να μαλακώσουν. Προσθέστε το σπανάκι και μαγειρέψτε για περίπου 2 λεπτά, μέχρι να αρχίσει να μαραίνεται. Προσθέστε το ψιλοκομμένο σκόρδο και μαγειρέψτε μέχρι να μυρίσει. Προσθέστε την πάστα ντομάτας και μαγειρέψτε για 1 λεπτό, ανακατεύοντας συχνά.

Προσθέστε και την πασάτα, τα ψημένα φασόλια, τα ιταλικά καρυκεύματα, το χυμό λεμονιού, το ξύδι, αλάτι και πιπέρι. Αφήστε να πάρει μια βράση, χαμηλώστε τη φωτιά και μαγειρέψτε για 8-10 λεπτά, ανακατεύοντας κατά διαστήματα.

Ανακατέψτε μέσα και τα φρέσκα μυρωδικά, 1 φλιτζάνι από τη μοτσαρέλα και ¼ φλιτζάνι από την παρμεζάνα. Πασπαλίστε ομοιόμορφα από πάνω με το υπόλοιπο τυρί. Προσθέστε και τα ντοματίνια από πάνω (εάν θα χρησιμοποιήσετε).

Τοποθετείστε στον προθερμασμένο φούρνο και ψήστε για 10 με 15 λεπτά, μέχρι να ροδίσουν οι πλευρές και το τυρί.

Σερβίρετε με χωριάτικο ψωμί!